Žilinská univerzita je členom projektu Slovenská infraštruktúra pre vysokovýkonné počítanie (SIVVP), ktorý bol schválený v marci 2009. Projekt bol zrealizovaný v roku 2012.

High performance computing (HPC) alebo vysoko výkonné počítanie (VVP) znamená využívanie (super)počítačov a počítačových clustrov na riešenie numericky alebo dátovo náročných úloh z rôznych odvetví vedy a techniky ako napríklad medicína, fyzika, chémia, ekonomika.

GRID UNIZA

Výpočtový cluster na UNIZA má výkon 4,39 TFLOPS (88% teoretického výkonu) a obsahuje:

46 x Compute node

• 2 x 6 jadrovy Intel(R) Xeon(R) CPU L5640 @ 2.27GHz
• 96GB RAM
• 2 x 500GB HDD
• OS Scientific Linux 6.3
• Ethernet, InfiniBand
• v 2 nodoch je grafická karta NVIDIA GF100 (Tesla M2070)

2 x Compute node

• 2 x 10 jadrovy Intel(R) Xeon(R) CPU E7- 8860 @ 2.27GHz
• 256GB RAM
• 2 x 300GB HDD
• OS Scientific Linux 6.3
• Ethernet, InfiniBand

Filesystem

• /home/$USER – xfs
• /work/$USER – xfs
• /apps – xfs
• /localscratch/$PBS_JOBID ($TMPDIR) – ext4
• celková kapacita 192 TB

Fronty úloh

• debug – walltime=30min, max 2 ulohy per user,
• serial – walltime=240 hod, mem=4gb,
• parallel – walltime=240 hod, max nodes=10, max ncpus=120.

Ako sa pripojiť na GRID UNIZA

Pre vzdialený prístup (pripojenie z IP adries mimo UNIZA) k GRID UNIZA môžete použiť VPN pripojenie. VPN pripojenie do siete UNIZA je dostupné pre systémy Windows a Linux.

VPN Profile pre pripojenie k GRID UNIZA získate od správcu (kontakt vľavo).

SSH Automatic Login

cd ~ ssh-keygen -t rsa cd ./.ssh cp id_rsa.pub authorized_keys chmod 600 authorized_keys ##cat id_rsa.pub >> authorized_keys // ak uz subor authorized_keys existuje, namiesto prikazu cp ssh comp01

Dostupný SW

• Matlab
• Matlab – TAH licencia
• Comsol
• Comsol – Cluster computing
• SIMPACK
• Ansys
• Genome Trax + ANNOVAR
• Mathematica

[tds_note]Všetky návody ako použiť vyššie uvedený SW nájdete v časti Návody.[/tds_note]